祝由之术是传统道法的一个重要分支，祝由科是对祝由之术的一个统称，源自祝由天医十三科的说法。“祝由”二字的本义是“祷告原由”，也就是向上天或神灵讲清楚自己的问题，以及可能的原因，并且真诚忏悔，按照符合规律的方法加以处理，问题就解决了。
清朝人许叔平在《里乘》卷三中说：“祝由氏治疾不用药，唯以清水一碗，以手捏剑诀，敕勒书符水面，以饮病者，亦无不效。”《里乘》中还说，“祝由氏为湖南辰州府人，故今辰州人，多擅此术，名曰‘祝由科’。为人治病，誓不受钱币之谢，或酬以酒食既可。然擅此术者虽多，而真得秘传者甚少，如得真传者，实有起死回生之功”。
故事一
清朝人张培仁在《妙香室丛话》卷14中记载了一件奇异的事情：
某年本处校场阅兵，有一个人眼睛被流矢射中，箭插得很结实拔不出来。赶紧寻访到了一个专业从事祝由科的人，是一个龙钟老太太。老太太到了现场，就让人把受伤的人用绳子捆在了东边的柱子上，老太太自己站在西边的柱子边上念咒，看热闹的人在老太太边上围了一圈。
念了半天咒之后，老太太让围观的人群稍稍退后，然后大喝一声，一歪头，受伤者眼里插的箭立刻从眼睛里反方向飞射出来，射中了西边的柱子，入木有一寸多深，离着老太太的鬓角只有几寸的距离。
围观的人大骇，再去看受伤者的眼睛，已经完好没有受伤的痕迹了。
旧时大庸（即今天湖南张家界市）县志也记载了一个名叫“金钩李胡子”的人，善于治疗伤痛。有一次，一位妇女患了乳痈，如果动手术，势必要用手触摸到妇女的乳房。“金钩李胡子”便念了一番咒语，将该妇女的乳痈转移到屋里的一根中柱上，便在中柱上动手术，结果，中柱上脓血直流，而妇女却毫无感觉。不久就将乳痈割了下来，而妇女的伤痛也很快就好了。
故事二
在《畅流》有一篇赵海涛先生写的《祝由科的邪门邪术》，报告他对祝由科的亲身所见与体验，文笔虽不免有些传奇性，却不失其真实性。赵海涛先生这样写的：
小时候，我们家住在江苏常州礼嘉桥。礼嘉桥是个仅有百余家铺面的小镇，濒运河支流北岸。每隔半年，准有一位光头，穿长袍布鞋的祝由科郎中出现。每次来就住在我们家隔壁的一小客栈里。清早起身，先在院子里焚香烧纸，膜拜天地，然后再开始街边摆地摊。
摆好地摊，他将一条长板凳竖起来，三脚悬空，一脚着地。口中念念有词，嘴停手松，长板凳并不倒下。随手在街边捡起一块大石头，轻轻的往板凳顶端一放，而石头与板凳竟四平八稳的，那石头是块不规则的黄石，足有二十来斤。
等到有人围拢过来，他就从小箱里拿出一张画了符的黄裱纸，吐把口沫，往店铺的门板上一贴（通常是已歇业店铺的门板），在黄裱纸中央钉一枚小洋钉。然后右手端起满满的一杯水，左手拿起一个直径约有一尺的小竹筛子，伸到面前，让观众过目以后，往杯口上一覆，嘴里念念有词，再迅速地将杯子与竹筛同时翻转过来，提起筛子边沿上的三根小绳子，扭在一起，往小洋钉上一挂，杯里的水，竟一滴都不漏出来。
摆出这两套架式，这位祝由郎中就坐在一张小破书桌后面，悠游自得地摇着折扇，大吹法螺。破书桌上面，摆着几本不知名的药书和几叠黄裱纸。每本书都是破旧不堪，字迹模糊难辨。
如有人身上长瘤、长疱、长疮，不论部位在哪一处，他从不叫患者揭开衣服来详细检视。只是以手指在患部大约估量一下尺寸，然后用黄裱纸剪一人形，吐把口沫，往门板上一贴。用毛笔在纸人上之相同部位画一圆圈，取银针一枚，轻轻插进那圆圈里，只听得患者大喊一声“哎哟”，血水与黄浓立刻自患部流了出来。这时，他趁机拿一副膏药卖给患者，让患者自行贴上，没几天就好了。
镇上有家豆腐店小孩子，约有七、八岁，面黄饥瘦，腹胀如鼓。找了很多医生看，服了不少的药，都不见效。最后孩子的母亲，以“不防试试”的心情，将他牵到这位祝由郎中跟前。
祝由郎中将孩子眼皮翻翻，在大肚皮上略略一按，然后对他的母亲大声说：“快拿马桶来！”“什么”他母亲有点莫名其妙：“拿马桶来派啥用场？”这时围观的人，也都是轰然大笑。祝由郎中不再说话，照样用黄裱纸剪个人形，贴在门上，拿起银针往纸人腹部一戮。不一会，只见那孩子双眉紧皱，两手棒着肚皮直嚷痛，他母亲见状，赶紧将他挽着回家，刚走到豆腐店门口，那孩子“樸”的放个响屁，接着一股黄水，像阵瀑布似的从肛门里泻了出来，流满一地，臭不可闻，从此腹胀也就霍然而愈。
我那时头上长有瘌痢，每天放学回家，总爱挤在那位祝由郎中的摊子跟前看热闹。他一看见我，就用扇子指着我，阴阳怪气的笑着说：“XX瘌痢头，赶快向我求。若要瘌痢好，给我嗑个头。”气的我转身就跑。
有一次，他拉着我说：“你拿一枚铜板给我，变个把戏给你看，铜板仍旧还给你，不要磕头，瘌痢也会好。”
于是我当着众人，疑信参半的掏了一枚铜元给他，他将铜元用一张黄裱纸包起来，放在我的右脚下面，要我踩着。一边用折扇轻敲着我的脑袋，一边轻声念那四句话：“XX瘌痢头，赶快向我求。若要瘌痢好，给我磕个头。”
念完叫我松开脚，捡起纸包打开一看，铜元没有了，只有很小一包黄色药粉。
“把药粉拿回去泡一杯水，抹在瘌痢上。”他说。
“铜板呢？”我说。
“铜板在你家后院的一棵桃树下面，赶快回去捡！”他说着把我推出了人群。
我拿着药粉跑回去一看，果然在桃树下面拾到了那枚铜元。而头上的瘌痢涂了药粉以后，不到几天就渐渐好了。家里的人，拿一枚袁大头去谢他，他坚持不受。
另一次，镇上有位姓徐的屠夫，人长得又肥又胖，平日吃喝嫖赌无所不来。他左手臂上生个疮流脓，久久不愈，于是去找这位祝由郎中诊治。
记得那时候已经快过年了，祝由郎中把屠夫端详了一阵，也不看他的疮，只是板起面孔对他说：“今年过年，切记要戒屠，手上的疮自然会好，如果不听，性命难保。”
屠夫一听好不高兴，于是问他什么原因，他不理，再问他，他却指着屠夫的脸孔说：“你杀生太多，又不孝顺父母。明年要变只猪，右前蹄则是只人手。”
屠夫大怒要揍他，却被观众拉开了。
过年的时候，那位祝由郎中已不知去向。姓徐的那位屠夫，据说根本不听祝由郎中的那一套，照旧杀猪不误，说也奇怪，刚过完年，屠夫就得急病死了。就在他死去的第二天早上，镇上有位寡妇养的母猪，生了三胎。其中一只小猪的右前蹄长得竟同人的手掌一模一样。见了人，还不时把“手掌”微微向上抬一下。这件怪事，立刻轰动了全镇，那家寡妇的猪栏边，整日围着看热闹的人，好几家照像馆都派人来照像。
几天以后，有位老和尚从别处赶来，花了二枚大头，把那只怪猪买了去，以后迄无下文。自从那次以后，那位祝由郎中再也没有到镇上来过。以上都是民国一、二年发生的事情，至今回想起来，仍似历历在目。
故事三
祝由科法门非常神奇，学了以后可以使死人排队行走。俗称“赶尸人”。前些时候遇到一个朋友，他亲戚就是会这个法门。村里人有什么问题，灵异鬼怪的事情都去找他帮助。
有一天，有人发现家中闹鬼，就请他去抓。他先画了一道符，带了个空瓶。跑到这个人家里。仅用空手一抓，就把鬼给装到瓶子里去了，贴上道符，然后叫小孩去听鬼惨叫的声音。小孩确实是听到了鬼叫的声音。那个巫师就把鬼放到后山去活埋了，叫他不得超生。
这样日子久了，孤魂野鬼都被他埋在后山上，越来越多了，村里也比以前太平了。
据说他还可以隔空拔牙。就是拔人的牙齿，不用老虎钳也可以拔下来。有一天来了个牙痛的老头，要求巫师帮助他拔牙。这个巫师搞清楚是哪一颗牙以后，就叫老头到隔壁去等。这个巫师只是在空中默默祷告，口中念念有词，大叫一声“起”。那老头没有感觉到疼痛，那只坏牙齿就应声掉了下来。
后来到了巫师39岁那年大夏天，后山上所有被活埋的鬼都获得了逃生，出来找那个巫师算帐讨命。巫师忽然感觉身体不太舒服。才刚睡在床上一会儿时间，用阴阳眼看到，房间里和山上全是鬼魂，情况万分危急。他心想要躲避今天这一关口，就一定要逃出村口，才可以活下去。
于是巫师马上雇来村里最大个的青年8名，要求他们帮他抬着他的身体出村口的老柳树下，并再三吩咐他们，一定要在他出村口前，千万不可让他的脚落到那泥土地上，否则他今天一定会死掉的。村里的人把门板钉在很粗的大木棍上，从床上抬着他，让他上了门板。
就这样8个年轻人扛着巫师出了村庄。可是他们刚刚到达村口的老柳树下，扛门板的小伙子发现门板的重量忽然变重了，觉得吃不消了，身体的皮肤也忽然冰凉侵体，一直冷到了骨子里去。有村里看热闹的乡邻也帮助他们死死地扛住门板，但是门板还是支撑不住历鬼压身的份量，据说约有300多个鬼都来找巫师索命，一场人鬼大战过后，木棍断裂了，巫师人也掉到了地上，巫师终于没有跑出村口半步。双脚落地了，巫师大叫，“我的寿命完了。”在巫师弥留之际，巫师说他很后悔自己以前所做的事情，并告戒大家“人以后不要做错事，不要太绝情啊，我后悔埋了那么多的鬼魂20年之久，真是报应啊。我该死。”并叫他的家人把那本《祝由科》的秘籍也烧了。
终于年轻的巫师死去了。
故事四
民国初年，作者认识一位教会医院的院长，是个德国医生。这人从德国来到中国行医治病，同时宣扬基督教。一天，作者去看望这个院长，院长说他自己病得很厉害，要回德国去做手术，以后能不能再来中国都很难说了。
作者问他得了什么病？他说背上长了一个巨大的疖疮，中间已经开始溃烂，手头的针和药都没有效果，必须回国做手术，再拖下去怕溃烂感染就保不住这条命了。
作者说我们中国人治疗疮疖之类的小病，有的是办法呀，你要不要试试。这个德国院长本来是不相信中医的，事到如今也只好拜托作者为他找个中医来看看，作者就给他找了一个祝由来看病。
怎么看呢？让这个德国人对着一颗树面东闭目而站，医师拿毛笔蘸了朱砂在树上画一个圈。然后站在德国人背后，嘴里念念有词，一边念叨一边拿朱砂笔在那个疖疮上画圈，越画越小，最后画到中心用笔一点，嘴里再念叨几句说声“好了”。
结果神奇的事情发生了：德国人说背不痛了，作者上前查看那个大疖疮已经不见了，只留了一点痕迹。德国人摸着背纳闷地问：大疖疮哪里去了？医师说：你们往树上看。这时候再看树上那个朱砂画的圈里，原来平整的树皮硬是鼓起一个包来，形状与德国人背上原来的大疖疮几乎一模一样，中间也是发黑的。可以想象到那个德国人的惊讶程度。
作者在文章最后写到：这是他所知道的中西医对抗中，中国祝由科的一次伟大胜利。
故事五
王亭之对祝由科感兴趣，是由于有一家街坊，姓邬，为番禺富户，他们家有一位小姐，生来驼背，后来曾一度为祝由科治好。后来这家人的十五少爷，恰恰与王亭之做同班同学，彼此来住甚密，听他的叙述，便更知道事情的始末。
他亲眼看着姊姊治驼背。祝由科医生来到，启坛画符唸咒一番，然后在大厅正中摆放一个“猪腰盘”──这种盘，上四十岁的人一定见过，用锌铁制造，给小孩子洗身，就用这种盘。
祝由科在盘内放下一只田鸡，吩咐主人家往盘内添上一寸水，然后在盘边放一矮凳，那就是广府人称为“凳仔”那一种。
摆设完毕，又在盘内烧一张符，便教人带那女孩出来，站在矮凳上。吩咐主人家，他一边念咒烧符，一边要叫女孩自动跳下盘内，不得推她。当时主人家见他准备一大叠符，心想，就这么一跳就完事了，要这么一叠符干吗？
谁知，那女孩子一站上矮凳，往盘中一望，就硬是不肯跳。女孩已经七八岁，照道理，就这一尺不到的高度，跳下去应该没有甚么可怕。全家人拼命鼓励她，她不跳就是不跳，眼见祝由科手上的符，已经烧了大半叠，众人不由得心焦。那祝由科半闭着眼睛念咒，也念得满头大汗。
就在这时，那祝由科便大喝一声了。
驼背女孩忽地脸色惨白，随即尖叫，人却已掉下盘中去了。众人才松一口气，皆大欢喜。
祝由科又往盘中烧符，不住念咒，良久事毕，吩咐主人家就用这个盘替女孩冲凉。可是，由于那女孩子的缘份不够，因此她必须终身不得吃田鸡，如若不然，驼背会复发。
说来奇怪，女孩经此一跳，慢慢就觉得她的脊骨长直了。一家人自然非常欢喜。
可是，他们是富户，讲究不时不食，每到田鸡肥美之时，自然享受田鸡食制，番禺人特别喜欢生滚田鸡粥，那时种田不下农药，田鸡便特别鲜美。
他们家孩子多，便不懂忌讳，吃田鸡必啧啧称好，那女孩只好听着，干流口水。她到底是女孩子心性，不知厉害，便老是缠着妈妈，要试一试田鸡的滋味。
如是捱了两年，又到田鸡当造的季节了，那母亲毕竟心软，有一次，就在田鸡腿上撕下小小一块肉，放在那女孩嘴中，让她嗒嗒味道。谁知这样一来，就闯出大祸。
那女孩背骨，从此便愈长愈曲，过得一年，驼得比从前还要厉害。再去找那祝由科时，祝由科拒绝再医治。
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