关于这个问题，有不同的解释。大多数科学家认为这与蜜蜂的主要交流方式——嗅觉有关。每当蜂巢附近有入侵者时，蜜蜂就会分泌警报信息素。信息素是一种动物分泌的物质，可引起同一物种的另一个个体的特定反应。警报信息素会触发其他蜜蜂的警报反应，使它们做好准备对入侵者发动攻击。如果你有机会打开一个蜂巢，那么，或许你会闻到类似香蕉的气味，这就是蜜蜂分泌的信息素的气味。但是烟熏的气味会掩盖信息素的气味，阻止其他蜜蜂接收入侵警报，因此它们没有做出抵抗的反应。
不过，也有人认为当蜂巢被烟熏时，蜜蜂们会认为发生了火灾，它们需要离开巢穴。作为对这种威胁的自然反应，它们会吃下尽可能多的蜂蜜——这有助于它们建立新家园。但是大量的进食会导致它们行动困难，昏昏沉沉。